细胞密度对于siRNA转染实验的影响是很大的。通常情况下，转染试剂成功转染siRNA的细胞会使得目标基因表达下调，但未成功转染的细胞却不受影响，这时转染效率和总的细胞数量就显得十分重要，密度过高或过低都会影响转染效果：
一般细胞数量较少时，转染效率高，但是一些转染试剂由于本身毒性的影响，细胞数量太低时毒性就变得明显，导致细胞死亡率也高，所以得到的转染效果并不可靠；
较多的细胞数量则会导致细胞过度接触和聚集在一起，这会减少转染试剂和siRNA到达单个细胞的机会，从而降低转染效率；并且，较高的细胞密度也可能导致细胞代谢活性下降，从而影响siRNA的敲除效率。
因此，在进行细胞转染实验时，需要根据转染试剂和细胞类型等因素来优化细胞密度，以提高转染效率和减少干扰。我们建议在使用Starvio siRNA转染试剂进行转染时，细胞密度控制在30-50%之间，考虑到细胞增殖的问题，在转染前一天铺板时的细胞密度一般为25%左右。如果使用24孔板进行培养，细胞数一般为每孔4*104个，具体数量可根据细胞增殖快慢进行调整。如果要使用较大的培养板，可在此基础上调整细胞铺板数，如12孔培养板，每孔可接种细胞数8*104个，建议实验者在此基础上进行适当的优化实验以选择最佳细胞接种数量。
此外，siRNA的转染和DNA的转染不一样，DNA的转染是过量表达，死亡一些细胞对过量表达的蛋白本身来说影响不大，但siRNA的转染，死亡的细胞所有的基因表达（包括特定目标基因）都下降，将与siRNA造成的特定目标基因的表达下降现象是一致的，将大大影响实验结果，因此选用低细胞毒性的转染试剂也非常重要。目前，普通转染试剂的主要成分为脂质体或聚乙烯亚胺（PEI），这两种成分都具有很大的细胞毒性，所以要求的细胞密度也较高，而Starvio siRNA采用的是新型可降解纳米材料，毒性很低，只需要30-50%的细胞密度就可进行转染，实验者可放心按照说明书进行，切勿带入常规转染试剂的细胞密度要求进行实验。
